L’électrophorèse 2D-DIGE (DIfferential Gel Electrophoresis) est une technique d’analyse différentielle de protéines sur gels bidimensionnels séparant les protéines en fonction de leur point isoélectrique et de leur masse.
 
Les échantillons protéiques à analyser sont marqués avec des fluorochromes différents possédant la même masse mais ayant des longueurs d’onde d’excitation et d’émission différentes. Ainsi, deux échantillons marqués avec des fluorochromes différents vont être mélangés et séparés sur un même gel. L’acquisition d’images aux longueurs d'onde spécifiques de chaque fluorochrome permet d’obtenir 2 images qui pourront être comparées en s’affranchissant des variations de migration entre gels, souvent observées lors d’analyses réalisées avec des gels bidimensionnels classiques.
 
Un autre avantage de cette technique est l’utilisation d’un standard interne pour la comparaison de plusieurs échantillons déposés sur plusieurs gels. Celui-ci est un mélange de tous les échantillons à analyser et possède ainsi toutes les entités protéiques de tous les échantillons. Cela facilite la correspondance entre les gels lors de l’analyse d’image mais permet également de calculer les ratios d’expression de chaque protéine sur un gel et de normaliser ces ratios d’expression entre les différents gels grâce à l’utilisation d’un logiciel d’analyse d’image dédié (Decyder). Ce logiciel permet également l’analyse statistique des ratios d’expression.
 
schema dige
 
 
Exemple d’application:
Recherche de protéines différentiellement exprimées dans des cellules ou des tissus après traitement ou induites par un état pathologique
 
Champs d’application :
Protéines cytosolubles et protéines sécrétées
 
Exemple de travaux réalisés sur notre site:
Rolland et al., 2007, J Proteome Res 6(2) : 683-697.
Collet et al., 2011, Proteome Science 9(1):16.
Gondret et al., 2012, J Proteomics 75(3):949-61.
Lincet et al., 2012, J Proteomics 75(4):1157-69.
Colinet et al., 2012, PloS ONE 7(2): e32606.
 
Revue:
Com et al., 2011, Methods Mol Biol 691:187-203.
 
Références :
Unlü M. et al., 1997 Electrophoresis 18 : 2071-7.
Alban A. et al., 2003 Proteomics 3 : 36-44.
boule disco